Posadka vesoljske ladje Enterprise se sredi petletne odprave na raziskovanju skrajnih kotičkov vesolja znajde pred eno svojih najhujših preizkušenj. Na oddaljenem, še neznanem koncu vesolja, jih iz zasede napade množičen in neustavljiv sovražnik pod vodstvom neusmiljenega vojaškega poveljnika Kralla, ki kapitana Kirka in njegovo posadko prisili, da zapustijo uničeno zvezdno plovilo ter poiščejo zatočišče na tujem planetu.
Brez možnosti, da bi oddali signal v sili, morajo kapitan Kirk, prvi častnik Spock, čemerni ladijski zdravnik Bones in zabavni vodja strojnice Scotty poskusiti navezati stik z zavezniki med Nezemljani, ki so že na planetu, in se skupaj upreti skrivnostnim sovražnikom. Ob pomanjkanju sodobnih tehničnih pripomočkov lahko računajo zgolj na pomoč uporniške vesoljske bojevnice Jaylah ter lastno iznajdljivost in pustolovski duh, če naj preprečijo medgalaktično vojno in množično smrt svojih rojakov.