Tretje nadaljevanje priljubljene sage režiserja Spielberga in scenarista Lucasa o Indiani Jonesu se začne z mladim Indyjem (igra ga pokojni River Phoenix), ki v vratolomnem začetku filma sooči gledalce s svojim okusom za pustolovščino, strahom pred kačami in trmasto odločenostjo, da bi zgodovinske najdenine odnesel iz rok koristoljubnežev v muzej, kamor sodijo.

Odrasli Indy (Harrison Ford) se spet pojavi v znani učilnici, kjer predava arheologijo pred velikansko množico zaljubljenih študentk leta 1938. G. Jones zapusti svojo službo, potem ko ga obišče zbiralec umetnin (Julian Glover) s predlogom, da bi našel tako iskani sveti gral. Okoliščine razkrijejo, da je slavno Kristusovo kupo iskal tudi neki drugi slavni arheolog – nihče drug kot Indyjev oče, dr. Henry Jones (Sean Connery), ki je pred kratkim izginil med iskanjem tega zaklada.

Oba Jonesova, mlajši in starejši, se kmalu znajdeta v nizu vratolomnih dogodivščin med Benetkami in najbolj odmaknjenimi kraji na Bližnjem vzhodu. Razmere še bolj zaplete Elsa (Alison Doody), privlačna in inteligentna ženska z eno samo napako: v resnici je nacistična agentka pod krinko. Iskanje svetega grala je nevarna naloga in najdba tega zaklada bo morda usodna za tiste, ki ga iščejo iz koristoljubja.