Zgodba pripoveduje o malem Jaku, ki odkrije ključ do skrivnosti, ki se razteza prek alternativnih resničnosti in skozi čas - pri tem pa razkrije skrivno zavetje, Dom gospodične Peregrine za nenavadne otroke. Ob spoznavanju prebivalcev doma in njihovih nenavadnih sposobnostih Jake dojame, da je varnost zgolj utvara in da resnična nevarnost preži v obliki mogočnih in skritih sovražnikov.