Zgodba se dogaja leta 2029, ko so mnogi ljudje postali kiborgi, saj so nekatere dele telesa zamenjali z umetnimi vsadki. Možganov pa ni mogoče zamenjati, zato ti predstavljajo ''duha'', torej človeško identiteto, ki je v školjki mehanskega telesa.
Postavna Major (Scarlet Johansson) je hibrid med človekom in kiborgom, zaradi posebnih bojnih sposobnosti pa jo postavijo za vodjo enote Sekcije 9, ki se ukvarja z najnevarnejšimi zločinci. Njihova glavna tarča je ekstremist, ki goreče nasprotuje kibernetični tehnologiji.
Toda v nasilnem svetu, kjer ne moreš nikomur zaupati, se resnica razkrije šele takrat, ko si drzneš odstraniti tančice svoje lastne preteklosti.