Zgodba sledi Tomovi duši skozi tri različne inkarnacije, ta pa želi s pomočjo drevesa življenja v vseh treh časovnih obdobjih obupano rešiti življenje sorodni duši Izzi. Najprej spoznamo Tomasa, konkvistadorja v 16. stoletju, ki želi služiti kraljici Isabel. Da bi rešil Španijo pred inkvizicijo, dobi nalogo, da najde drevo in se z neustrašnimi vojaki odpravi v majevsko džunglo.

V sodobnosti dr. Tom Creo sodeluje v revolucionarnih raziskavah tumorja možganov. S tem postane obseden, ko tudi njegova žena Izzie zboli za tumorjem. Ker ima zelo malo dragocenega časa, mora Tom pohiteti s svojimi raziskavami, da bi svojim sočutnim (toda pragmatičnim) nadrejenim razkril uganko drevesa ter rešil svojo ženo.

Svetlobna leta pozneje Tommy prenese drevo v mistični predel galaksije. Ko se spominja Izzie in svojih prejšnjih življenj, potuje v meglico, ki obema zagotavlja ponovno rojstvo …