V Možeh v črnem 3 se agenta J. (Will Smith) in K. (Tommy Lee Jones) vračata v času nazaj. J. je pri svojem delu z Možmi v črnem v zadnjih 15 letih videl marsikaj, vendar ga prav nič, tudi vesoljci, ne spravlja tako ob živce kot njegov čemerni in zadržani sodelavec. Ko pa sta življenje K.-ja in usoda planeta v nevarnosti, mora agent J. odpotovati nazaj v času, da bi uredil stvari.

J. odkrije, da mu nekaterih skrivnosti vesolja K. nikoli ni zaupal – zdaj pa se jima bodo razodele, ko se J. spajdaši z mlajšo različico agenta K. (Josh Brolin), da bi skupaj rešila tisto starejšo različico, agencijo in prihodnost človeštva.