Iskalec zakladov Ben Gates (Nicolas Cage) se po treh letih znova vrača, a tokrat je njegova pustolovščina še bolj osebna, saj mora oprati družinsko ime. Najdene izgubljene strani iz dnevnika morilca ameriškega predsednika Abrahama Lincolna namigujejo, da je bil v zaroto vpleten tudi Benov prapradedek.

Da bi dokazal nedolžnost svojega prednika, se Ben poda na težavno razkrivanje sledi in ugank iz preteklosti, ki ga vodijo od Pariza do Londona, toda dokončni odgovor se skriva v Knjigi skrivnosti, do katere se lahko dokoplje le tako, da ugrabi predsednika ZDA.