Hrvaško vojaško mornarico so ustanovili v nemirni jeseni 1991. Najprej je bilo treba poskrbeti za opremo, ladje, orožje, strelivo, hkrati pa pregnati jugoslovansko mornarico iz nacionalnih voda.
Po vojni sta bili oblikovani Flota in Obalna straža, sledili so modernizacija opreme ter nove naloge in misije. Hrvaška vojaška mornarica je vključena v Partnerstvo za mir in zvezo NATO, deluje tudi v akcijah v Sredozemlju.
V mornarici skrbijo za urjenje, šolanje, kulturo, šport, humanitarne aktivnosti.