Film pripoveduje zgodbo o desetletni pastirici in njenih dveh mlajših bratrancih, ki so skupaj doživeli vizijo Marijinega prikazovanja. Njihova pripoved navdihne vernike, ki množično drejo v Fatimo in vznemirijo oblasti, predvsem verske, ki si ne želijo nepredvidljive množice neprivilegiranih ljudi, saj se morajo ukvarjati s krvavo vojno, ki divja v Evropi. Zato avtoritete vztrajajo, da morajo pastirji svojo zgodbo umakniti.
Ljudje nasprotno, verjamejo otrokom in pastirjem, ki jim uspe priklicati Marijo. Ko se jim prikaže, napove obdobje trpljenja in molitve, a na koncu je luč - konec prve svetovne vojne. Fatima je film, ki temelji na resničnih dogodkih in je navdihujoča zgodba o moči vere.