Cal Lynch (Michael Fassbender) je bil že v otroštvu zaznamovan s tragedijo. Zdaj je zapornik, obsojen na smrt. Nato pa se mu nepričakovano ponudi nova priložnost v obliki skrivnostnega podjetja Abstergo Industries.

S pomočjo revolucionarne tehnologije, ki odklene genske spominske zapise v njegovi DNK, Cala pošljejo nazaj v času, v Španije v 15. stoletju. Tam podoživi izkušnje svojega daljnega prednika Aguilarja de Nerhe, pripadnika skrivne družbe Asasinov, ki se za možnost svobodne volje borijo s pohlepnim redom Templjarjev.

Preteklost ga spremeni in Cal začne pridobivati znanje in veščine, ki so potrebni za to, da se bo tudi v sedanjosti uprl izkoriščevalski organizaciji Templjarjev.